解决方案
- 转录水平RNA高通量研究为人们深入分析生物学过程中转录调控、信号转导机制、疾病分子病理分型等给予了重要的研究方法。常用的高通量研究方法如基因芯片、RNA测序等,可产生大量信息,然而这些技术对样品质量要求很高,同时费用昂贵。且其实验结果往往需要做qPCR进行验证。然而在对多基因进行定量研究时,传统的qPCR方法由于实验操作步骤多且繁复,通量明显不足,无法满足多重基因定量检测的需求。此外,临床样品通常为FFPE样本,在制备和储存过程中会造成大量RNA降解、断裂。因此,qPCR及RNA-seq都难以对这种样本进行精确定量分析。针对以上问题,NanoString给出了完美的解决方案:基于杂交原理建立的NanoString数字化基因分析系统直接检测条形码探针标记的单个mRNA转录子,并顺利获得数字计数进行定量。此过程无需酶促和扩增过程。仅需100 ng的RNA即可对逾八百个特异的mRNA转录子进行准确的定量。其检测的敏感性和准确性与实时定量PCR(RT—PCR) 技术相当。
- NanoString技术可以不经过RNA提取,直接在FFPE样本,细胞裂解液乃至全血中对RNA进行定量,进一步降低由于提取过程可能带来的潜在偏差。近年来,NanoString技术被越来越广泛地应用到生物医学前沿领域,包括高通量基因表达结果验证、基因表达谱研究、基因调控网络研究、临床疾病分子分型及诊断预后等领域。